Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CatipB9EKE5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms