Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pdzd8B9EJ80 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms