Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3173A6NAS3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3173A6NAS3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms