Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms