Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb4A2A863 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb4A2A863 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms