Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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