Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CcniQ9Z2V9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms