Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc2Q9Z2H7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gipc2Q9Z2H7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gipc2Q9Z2H7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms