Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ccne2Q9Z238 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccne2Q9Z238 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms