Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cpne6Q9Z140 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpne6Q9Z140 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms