Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z129

Recql, ATP-dependent DNA helicase Q1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RecqlQ9Z129 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RecqlQ9Z129 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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RecqlQ9Z129 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RecqlQ9Z129 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms