Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nme3Q9WV85 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nme3Q9WV85 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms