Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp1a4Q9WV27 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp1a4Q9WV27 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms