Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Psma4Q9R1P0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Psma4Q9R1P0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms