Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChmlQ9QZD5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChmlQ9QZD5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms