Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Irx4Q9QY61 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms