Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-OaQ9QWV1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-OaQ9QWV1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms