Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hdgfl3Q9JMG7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hdgfl3Q9JMG7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms