Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLQ0

Cd2ap, CD2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd2apQ9JLQ0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cd2apQ9JLQ0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cd2apQ9JLQ0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms