Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ropn1Q9ESG2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms