Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubb3Q9ERD7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms