Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB07

Ift46, Intraflagellar transport protein 46 homolog, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift46Q9DB07 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift46Q9DB07 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift46Q9DB07 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift46Q9DB07 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift46Q9DB07 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ift46Q9DB07 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ift46Q9DB07 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ift46Q9DB07 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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