Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hm13Q9D8V0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hm13Q9D8V0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms