Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Capn9Q9D805 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn9Q9D805 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms