Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Mrpl28Q9D1B9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms