Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zbed3Q9D0L1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms