Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Mrpl11Q9CQF0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Mrpl11Q9CQF0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms