Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krcc1Q99JT5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms