Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc71Q8VEG0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc71Q8VEG0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms