Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cnot6Q8K3P5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot6Q8K3P5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms