Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SynpoQ8CC35 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SynpoQ8CC35 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms