Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rnf170Q8CBG9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rnf170Q8CBG9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Rnf170Q8CBG9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf170Q8CBG9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf170Q8CBG9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rnf170Q8CBG9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rnf170Q8CBG9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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