Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q8C1R3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms