Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdcl3Q8BVF2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdcl3Q8BVF2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms