Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zcchc4Q8BKW4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms