Protein–RNA interactions for Protein: Q811S7

Ubp1, Upstream-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1Q811S7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ubp1Q811S7 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms