Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ino80Q6ZPV2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ino80Q6ZPV2 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms