Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Pcp4l1Q6W8Q3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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