Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Atp8b3Q6UQ17 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Atp8b3Q6UQ17 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Atp8b3Q6UQ17 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Atp8b3Q6UQ17 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Atp8b3Q6UQ17 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Atp8b3Q6UQ17 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms