Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gja6Q6S5G4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gja6Q6S5G4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms