Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtifQ6PEE2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CtifQ6PEE2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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