Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gga2Q6P5E6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms