Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpsf6Q6NVF9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms