Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt72Q6IME9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt72Q6IME9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt72Q6IME9 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms