Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itga3Q62470 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itga3Q62470 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms