Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sox17Q61473 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sox17Q61473 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sox17Q61473 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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