Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsx2Q61412 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsx2Q61412 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms