Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Klf3Q60980 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf3Q60980 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms