Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Sco1Q5SUC9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Sco1Q5SUC9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Sco1Q5SUC9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sco1Q5SUC9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms