Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rtl5Q5DTT4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtl5Q5DTT4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms